首先申請ISO14001環境管理體系認證的企業向認證機構提交申請材料經過審查是否符合兩個基本條件。

申請受理后認，證機構進入第一階段審核，這一階段主要審核體系文件和體系的策劃、資源提供、內審和管理評審，結合現場審核，確認審核范圍，提出整改意見。企業整改合格后，進入第二階段審核第二階段主要是現場審核。審核結束后，認證機構根據審核結果形成推薦意見并組織合格評定通過認證決定后頒發證書．證書有效期為三年。